Województwo Małopolskie pełni aktualnie funkcję organu założycielskiego dla 18 jednostek ochrony zdrowia, w tym 14 szpitali, 1 pogotowia ratunkowego oraz 3 jednostek opieki ambulatoryjnej. Są to:
- Krakowski Szpital Specjalistyczny im. Jana Pawła II
- Szpital Specjalistyczny im. Jędrzeja Śniadeckiego w Nowym Sączu
- Wojewódzki Szpital im. św. Łukasza w Tarnowie
- Szpital Specjalistyczny im. dr. Józefa Babińskiego
- Szpital Specjalistyczny im. Józefa Dietla
- Wojewódzki Specjalistyczny Szpital Dziecięcy im. św. Ludwika
- Wojewódzki Szpital Okulistyczny
- Krakowskie Centrum Rehabilitacji
- Wojewódzki Szpital Psychiatryczny w Andrychowie
- Wojewódzki Szpital Chorób Płuc w Jaroszowcu
- Wojewódzki Szpital Rehabilitacyjny im. dr. S. Jasińskiego w Zakopanem
- Ośrodek Rehabilitacji Narządu Ruchu „Krzeszowice”
- Małopolskie Centrum Rehabilitacji Dzieci "Solidarność" w Radziszowie
- Zakład Długoterminowej Opieki Medycznej im. św. Katarzyny Sieneńskiej w Makowie Podhalańskim
- Krakowskie Pogotowie Ratunkowe
- Wojewódzka Przychodnia Stomatologiczna im. dr. n. med. Zbigniewa Żaka
- Centrum Medyczne "Kol-Med" SPZOZ w Tarnowie
- Małopolski Ośrodek Medycyny Pracy.
Jednostki te są istotnie zróżnicowane pod względem charakteru działalności, a także wielkości (liczba łóżek, zatrudnionego personelu, infrastruktury, itp.). Szpitale wieloprofilowe, kilkusetłóżkowe, zatrudniające setki osób oraz prowadzące działalność w szerokim zakresie posiadające wiele różnorodnych oddziałów. Ich przeciwieństwem są jednostki jednoprofilowe, których profil działalności nie jest zróżnicowany. Są to małe jednostki np. o profilu rehabilitacyjnym, posiadające mniej łóżek (do 150) oraz zatrudnionego personelu.